根瘤菌在侵入植物根部后会分泌一些物质能刺激根毛的薄壁细胞很快增殖形成`肿瘤'．在瘤中,瘤菌是依赖于植物提供营养来生长、繁殖,同时,它们也有一种特殊的本领,它们随身带有一种奇妙的物质——固氮酶,可以把空气中游离的氮固定下来,供给植物利用,这叫固氮作用．一个小小的根瘤就像一个微型化肥厂一样源源不断地把氮变成氨送给植物吸收．
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